MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 33140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000854	GGA	2	6	27596	27601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600404
502	NC_000854	AGG	2	6	27653	27658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600404
503	NC_000854	GTC	2	6	27684	27689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600404
504	NC_000854	GAT	2	6	27780	27785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600404
505	NC_000854	GAC	3	9	27861	27869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600404
506	NC_000854	ACG	2	6	27883	27888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600404
507	NC_000854	ATA	2	6	27891	27896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600404
508	NC_000854	CCT	2	6	27928	27933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600404
509	NC_000854	TCC	2	6	27940	27945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600404
510	NC_000854	AAG	2	6	27990	27995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600404
511	NC_000854	ATC	2	6	28032	28037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600404
512	NC_000854	TA	3	6	28044	28049	50 %	50 %	0 %	0 %	14600404
513	NC_000854	CGA	2	6	28058	28063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600404
514	NC_000854	GAT	2	6	28094	28099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600404
515	NC_000854	GACC	2	8	28149	28156	25 %	0 %	25 %	50 %	118430853
516	NC_000854	CTT	2	6	28157	28162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430853
517	NC_000854	TAC	2	6	28230	28235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430853
518	NC_000854	CCAGG	2	10	28303	28312	20 %	0 %	40 %	40 %	118430853
519	NC_000854	CTA	2	6	28323	28328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430853
520	NC_000854	CGT	2	6	28367	28372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430853
521	NC_000854	CT	4	8	28388	28395	0 %	50 %	0 %	50 %	118430853
522	NC_000854	GGA	2	6	28412	28417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430853
523	NC_000854	ATG	2	6	28473	28478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430853
524	NC_000854	CCTT	2	8	28519	28526	0 %	50 %	0 %	50 %	118430853
525	NC_000854	CCT	2	6	28634	28639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430853
526	NC_000854	AT	3	6	28665	28670	50 %	50 %	0 %	0 %	118430853
527	NC_000854	GGT	2	6	28673	28678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430853
528	NC_000854	AAC	2	6	28736	28741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430853
529	NC_000854	ATTG	2	8	28802	28809	25 %	50 %	25 %	0 %	118430853
530	NC_000854	GA	3	6	28828	28833	50 %	0 %	50 %	0 %	118430853
531	NC_000854	CAT	2	6	28894	28899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430853
532	NC_000854	CT	3	6	28910	28915	0 %	50 %	0 %	50 %	118430853
533	NC_000854	CT	4	8	28940	28947	0 %	50 %	0 %	50 %	118430853
534	NC_000854	TAA	2	6	29105	29110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600406
535	NC_000854	ATA	2	6	29140	29145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600406
536	NC_000854	TTC	2	6	29197	29202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600406
537	NC_000854	CCA	2	6	29218	29223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600406
538	NC_000854	CAT	2	6	29292	29297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600406
539	NC_000854	TCT	2	6	29388	29393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600406
540	NC_000854	TAG	2	6	29432	29437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600406
541	NC_000854	CCT	2	6	29463	29468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600406
542	NC_000854	GTA	2	6	29474	29479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600406
543	NC_000854	GGT	2	6	29595	29600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600406
544	NC_000854	GGT	2	6	29607	29612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600406
545	NC_000854	AGG	2	6	29626	29631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600406
546	NC_000854	GCT	2	6	29638	29643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600406
547	NC_000854	AGT	2	6	29667	29672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600406
548	NC_000854	ACT	2	6	29688	29693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600406
549	NC_000854	GAG	2	6	29712	29717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600406
550	NC_000854	CCT	2	6	29742	29747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600406
551	NC_000854	CTC	2	6	29770	29775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600406
552	NC_000854	AGG	2	6	29891	29896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600406
553	NC_000854	TG	3	6	29942	29947	0 %	50 %	50 %	0 %	14600407
554	NC_000854	TCA	2	6	30046	30051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600407
555	NC_000854	TAA	2	6	30055	30060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600407
556	NC_000854	ACA	2	6	30115	30120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600407
557	NC_000854	AGA	2	6	30134	30139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600407
558	NC_000854	ACA	2	6	30145	30150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600407
559	NC_000854	AGG	2	6	30153	30158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600407
560	NC_000854	TA	3	6	30206	30211	50 %	50 %	0 %	0 %	14600407
561	NC_000854	TCA	2	6	30344	30349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600407
562	NC_000854	GCAGAG	2	12	30362	30373	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	14600407
563	NC_000854	TTC	2	6	30412	30417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600407
564	NC_000854	TAG	2	6	30478	30483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600407
565	NC_000854	AGG	2	6	30493	30498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600407
566	NC_000854	GCA	2	6	30533	30538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600407
567	NC_000854	GGC	2	6	30539	30544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600407
568	NC_000854	AAG	2	6	30642	30647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600407
569	NC_000854	GAGGT	2	10	30655	30664	20 %	20 %	60 %	0 %	14600407
570	NC_000854	AGTG	2	8	30667	30674	25 %	25 %	50 %	0 %	14600407
571	NC_000854	TA	3	6	30703	30708	50 %	50 %	0 %	0 %	14600408
572	NC_000854	ACA	2	6	30729	30734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600408
573	NC_000854	TTG	2	6	30735	30740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600408
574	NC_000854	GAG	2	6	30763	30768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600408
575	NC_000854	ACC	2	6	30804	30809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600408
576	NC_000854	CGT	2	6	30835	30840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600408
577	NC_000854	GAG	2	6	30842	30847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600408
578	NC_000854	TTC	2	6	30857	30862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600408
579	NC_000854	CTC	2	6	30893	30898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600408
580	NC_000854	CCT	2	6	30921	30926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600408
581	NC_000854	AG	3	6	30956	30961	50 %	0 %	50 %	0 %	14600408
582	NC_000854	AGG	2	6	30991	30996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600408
583	NC_000854	CAG	2	6	31016	31021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600408
584	NC_000854	AGAC	2	8	31116	31123	50 %	0 %	25 %	25 %	14600408
585	NC_000854	CGATG	2	10	31144	31153	20 %	20 %	40 %	20 %	14600408
586	NC_000854	CCT	2	6	31204	31209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600408
587	NC_000854	AG	3	6	31225	31230	50 %	0 %	50 %	0 %	14600408
588	NC_000854	CAA	2	6	31415	31420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430854
589	NC_000854	CTC	2	6	31491	31496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430854
590	NC_000854	CCG	2	6	31499	31504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430854
591	NC_000854	CAG	2	6	31509	31514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430854
592	NC_000854	CTC	2	6	31521	31526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430854
593	NC_000854	AC	3	6	31538	31543	50 %	0 %	0 %	50 %	118430854
594	NC_000854	C	6	6	31578	31583	0 %	0 %	0 %	100 %	118430854
595	NC_000854	TGC	2	6	31617	31622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430854
596	NC_000854	GAA	2	6	31653	31658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430854
597	NC_000854	CCGT	2	8	31678	31685	0 %	25 %	25 %	50 %	118430854
598	NC_000854	CAC	2	6	31706	31711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430854
599	NC_000854	TA	4	8	31850	31857	50 %	50 %	0 %	0 %	118430854
600	NC_000854	CAG	2	6	31895	31900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430854
601	NC_000854	CTG	2	6	32020	32025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430855
602	NC_000854	GGC	2	6	32057	32062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430855
603	NC_000854	AGG	2	6	32137	32142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430855
604	NC_000854	TC	3	6	32253	32258	0 %	50 %	0 %	50 %	118430855
605	NC_000854	AC	3	6	32276	32281	50 %	0 %	0 %	50 %	118430855
606	NC_000854	GTC	2	6	32293	32298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430855
607	NC_000854	TAT	2	6	32308	32313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430855
608	NC_000854	TCA	2	6	32370	32375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430855
609	NC_000854	GAT	3	9	32473	32481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430855
610	NC_000854	GGA	2	6	32519	32524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430855
611	NC_000854	ACC	2	6	32525	32530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430855
612	NC_000854	AGA	2	6	32571	32576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430855
613	NC_000854	CTT	2	6	32624	32629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430855
614	NC_000854	GTG	2	6	32661	32666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430855
615	NC_000854	CCG	2	6	32759	32764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430855
616	NC_000854	CACC	2	8	32776	32783	25 %	0 %	0 %	75 %	118430855
617	NC_000854	TAT	2	6	32814	32819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430855
618	NC_000854	AT	3	6	32818	32823	50 %	50 %	0 %	0 %	118430855
619	NC_000854	CTA	2	6	32859	32864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430855
620	NC_000854	CTA	2	6	33055	33060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430856
621	NC_000854	ACTTG	2	10	33061	33070	20 %	40 %	20 %	20 %	118430856
622	NC_000854	CAT	2	6	33222	33227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430856
623	NC_000854	CTG	2	6	33249	33254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430856
624	NC_000854	TAG	2	6	33263	33268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430856
625	NC_000854	GA	3	6	33317	33322	50 %	0 %	50 %	0 %	118430856
626	NC_000854	CCTT	2	8	33364	33371	0 %	50 %	0 %	50 %	118430856
627	NC_000854	CTG	2	6	33381	33386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430856
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629	NC_000854	TCCT	2	8	33492	33499	0 %	50 %	0 %	50 %	118430856
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